Permanecem:

Pôr (verbo) para diferenciar de por (preposição):
Posso pôr meu carro aqui? (verbo)
Fiz isso por conta daquilo. (preposição)

Pôde (passado) para diferenciar de pode (presente):
Como ele pôde esquecer a noiva no altar?
Se continuar ruim, ela pode pedir divórcio.

Têm (plural) para diferenciar de tem (singular):
Todas as rosas têm espinhos.
O jardineiro tem muito a ensinar.

Vêm (plural) para diferenciar de vem (singular):
Elas vêm para cima com tudo.
Nem vem que não tem.

* E seus derivados:
Eles contêm, detêm, intervêm, mantêm, provêm.
Ele contém, detém, intervém, mantém, provém.

Mas com o Acordo Ortográfico caiu:
Pára (verbo) a diferenciar de para (preposição):
Agora a interpretação é pelo contexto da frase:
Trânsito para a cidade e causa caos (verbo parar).
Ideias para uma cidade inclusiva (preposição para).

---